ইন্দুরকানী উল্লেখ্যযোগ্য নদী বলেশ্বর, কঁচা,পানগুছি। উপজেলাটির পূর্বদিকে কঁচা নদী,দক্ষিণ এ পশ্চিম দিকে পানগুছি নদী এবং ২০০৭ সালের ১৫ নভেম্বর মধ্যরাতে দেশের দক্ষিণ পশ্চিম ও দক্ষিণ পূর্ব জনপদে আঘাত হানা প্রলংকরী ঘূর্নিঝড় সিডরের উৎপত্তিস্থল এই বলেশ্বরনদী ইন্দুরকানী উপজেলার মাঝ দিয় প্রবাহিত হয়ে পূর্বে কঁচা নদীর সাথে মিলিত হয়েছে। এবং কঁচা নদীর নাম ধারণ করে বঙ্গোপসাগরে গিয়ে পতিত হযেছে। বর্তমানে বলেশ্বর নদীতে একটি ব্রীজ নির্মাণ করা হয়েছে যা ইন্দুরকানী ব্রীজ নামে পরিচিত।
কঁচা ও বলেশ্বর নদীর তীর পানি উন্নয়ণ বোর্ড কর্তৃক বেড়ী বাধ নির্মাণ করা আছে। এ নদীর মাধ্যমে ষ্টীমার ঢাকা থেকে খুলনা রুটে চলাচল করে এবং ছোট বড় অনেক লঞ্চ, ট্রলার,অসংখ্য নৌকা চলাচল করে ও একস্থান থেকে মালামাল আনানেওয়া করা হয়। এই নদীতে অনেক মাছ পাওয়া যায়। মাছ ধরে বহু লোকজন জীবিকা নির্বাহ করে থাকে। মাছের মধ্যে ইলিশ, তপসে, পোয়া, আইর, বোয়াল, কোড়াল,রিটা,চিতল ও আরো বহু প্রজাতির ছোট বড় মাছ উল্লেখযোগ্য।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস